Domus Dorpatensis asutati 2002. aastal Bonni ülikooli professori Alexander von Rückeri, Columbia ülikooli professori Jenik Radoni ja Balti ajalooliste hoonete restaureerimise ühingu presidendi Nils Hollbergi poolt. Sihtasutus loodi professor von Rückeri perekonna endises kodus, kohe Tartu Raekoja kõrval. Selle eesmärgiks oli toetada Eesti ühiskonna arengut, kutsudes ellu koha, kus teadus, kunstid, kodanikuühiskond, keskkonnakaitse ja muud olulised ühiskonna valdkonnad leiaksid kodu ja toetust.
Domus Dorpatensis on enamat, kui ajalooline hoonestu või sihtasutus. See on sõltumatu kodanikuühiskonna platvorm, kus kohtuvad teadus- ja kunstiloome ning vastutustundlik kodanikuaktiivsus. Koos tegutsetakse Eesti, aga ka laiemalt inimkultuuri elujõu tugevdamise nimel. Kultuuri all mõistame seejuures mitte pelgalt seda, mis kuulub kultuuriministeeriumi haldusalasse ja mida ei saa nimetada sõnaga “sport”, vaid inimliigi elususkohastumust, mille abil vanemad põlvkonnad vahetavad omavahel ja annavad noorematele edasi mittegeneetiliselt levivat infot ja inimeste saavutusi.
Lisaks erinevate tegevusvaldkondade inimeste omavahelisele suhtlemisele ja koostööle on seetõttu oluline ka suhtlus ja koostöö erinevate põlvkondade vahel. Domus Dorpatensises loob võimalusi, mis annavad sisulise põhjuse koosolemiseks ja -toimetamiseks mitme erineva põlvkonna esindajate jaoks.
Domus Dorpatensise inimesed usuvad, et vastupidavad ühiskonnad on rajatud mitte ainult majanduslikul edul või tehnoloogilisel arengul, vaid usaldusel, dialoogil, teaduslikul mõtlemisel, kultuurilisel mõtestamisel ja aktiivsel kodanikuosalusel. Tõmmates kokku teadlasi, kunstnikke, ettevõtjaid, õpetajaid, õppijaid ja kodanikke laiemalt, loob Domus Dorpatensis ainulaadse silla, kus ideid saab vabalt, vastutustundlikult ja koostöös uurida ning ellu kutsuda.
Selle ühendava ja kandva silla mõte ei ole pakkuda valmisvastuseid. Selle silla mõte on luua tingimusi, milles saavad tekkida paremad küsimused, tugevamad tegijate kogukonnad ja targemad või huvitavamad otsused.
Domus Dorpatensis on seega turvaline ja lahke kohtumispaik. Ka ohtlikele ideedele.